
Indica Labs’ Japan HALO® User Group Meeting
Date: 25 October 2024
Time: 10:00 – 16:30 (GMT+8)
Location: TEKKO executive lounge & conference rooms
For more information, please email japan@indicalab.com.
Agenda
Time | Topic | Presenters | |
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9:30 - 10:00 | Check-In | ||
10:10 - 10:20 | Welcome Address | Hideya Makino Director of Japan, Indica Labs | |
10:20 – 11:00 | Evaluation of Tumor-Infiltrating Lymphocytes in Triple-Negative Breast Cancer Using HALO-AI HALO-AIを用いたトリプルネガティブ乳癌における腫瘍浸潤リンパ球の評価 Among breast cancers, hormone receptor-negative and HER2-negative triple negative breast cancer (TNBC) is a heterogeneous group of breast cancers. Several subtypes have been proposed based on the analysis of comprehensive gene expression profiles, among which a subtype with high expression of genes related to immune function is known. Histologically, this subtype has a high infiltration of tumor-infiltrating lymphocytes (TILs) and is often reported to have a good prognosis. Although most of the histological evaluation methods for TILs are based on the evaluation of the area occupied by TILs in the stroma using HE-stained specimens in a manual manner, in this study, we quantitatively evaluated CD3 and CD8 immunostained specimens by HALO-AI and evaluated their relationship with prognosis. 乳癌の中でも, ホルモン受容体陰性かつHER2陰性のトリプルネガティブ乳癌 (triple negative breast cancer [TNBC]) は不均質な乳癌の集まりである. 網羅的遺伝子発現プロファイルの解析によりいくつかのサブタイプが提唱されているが, その中で免疫機能に関する遺伝子が多く高発現しているサブタイプが知られている. そのサブタイプは組織学的には腫瘍浸潤リンパ球 (tumor-infiltrating lymphocytes [TILs]) の浸潤が高度であり, 予後が良いという報告が多い. TILsの組織学的な評価方法はHE染色標本を用いてmanualで間質のTILsの占有面積を評価したものが多いが, 今回我々はCD3及びCD8の免疫染色標本をHALO-AIで定量的評価を行い, 予後との関連について評価した. いが, 今回我多いが | Makiko Koga Department of Basic Pathology, National Defense Medical College 古賀 麻希子 先生 防衛医科大学校 病態病理学講座 | |
11:00 – 11:40 | Case Studies of HALO Application in Pathological Evaluation 病理評価におけるHALO活用事例について In recent years, the rapid advancement of AI (Artificial Intelligence) technology has been remarkable, and its application in various aspects of drug development is highly anticipated. Furthermore, the swift digitalization of pathological evaluations in the field of non-clinical research is widely recognized. Our company introduced HALO and a digital slide scanner three years ago, and we have been utilizing image analysis, particularly for efficacy pathology evaluations in animal models of disease used in drug discovery research. HALO is known as a highly user-friendly tool, as it allows beginners to easily use its various modules without requiring the advanced IT knowledge that was previously deemed essential for image analysis. In this presentation, I will share my insights as a HALO user and introduce case studies of image analysis using HALO in our pathological evaluations. Additionally, I hope to create an opportunity to share the challenges, questions, and requests that have arisen from these analyses. This presentation will also include a session led by staff from Indica Labs, who will propose efficient analysis methods using HALO or HALO AI, as well as introduce further examples of advanced applications. 近年、AI(人工知能)技術の発展は目覚ましく、医薬品開発のさまざまな場面での活用が期待されている。また、非臨床研究分野における病理評価のデジタル化も急速に進んでいることは、広く認識されているところである。当社では、3年前からHALOおよびデジタルスライドスキャナーを導入し、特に創薬研究における病態モデルでの薬効病理評価において画像解析に取り組んでいる。HALOは、これまで画像解析に必要とされていた高度なIT知識がなくても、多彩なモジュールを使用することで初心者にも非常に使いやすいツールとして知られている。 本発表では、HALOユーザーとしての所感を述べ、弊社での病理評価におけるHALOを用いた画像解析事例を紹介する。また、その解析事例で生じた課題・疑問や要望を、皆さんと共有する場としたい。なお、本発表内においてIndica Labs社のスタッフよるセッションを組み込んでおり、HALOあるいはHALO AIを使用する効率的な解析法の提案や、さらなる応用解析事例についてご紹介いただける予定である。 | Makiko Yamaoka Kyorin Pharmaceutical Co., Ltd. Watarase Research Center Toxicology Research Laboratory 山岡 牧子 様 杏林製薬わたらせ創薬センター安全性研究所 | |
11:40 - 12:10 | Optimizing Digital Pathology Infrastructure Through Cloud Services クラウドサービスによるデジタルパソロジーインフラストラクチャーの最適化 This presentation will explore how the Indica Labs Cloud Services team can elevate your HALO infrastructure through customized cloud solutions. Our expert engineers, proficient in both cloud technology and digital pathology, provide optimized deployments and exceptional support. Additionally, you’ll learn about our comprehensive support offered by our Technical Solutions team, ensuring you receive exceptional ongoing assistance for all your technical needs. Indica Labsのクラウドサービスチームがカスタマイズされたクラウドソリューションを通じて、どのようにHALOインフラストラクチャーを向上させることができるかを探ります。クラウド技術とデジタル病理学の両方に精通した当社の専門エンジニアが、最適化されたデプロイメントと優れたサポートを提供します。また、当社のテクニカルソリューションチームによる包括的なサポートについてもご紹介し、あらゆる技術的ニーズに対して継続的で質の高い支援を確実に受けられることをお伝えします。 | Billy Heseltine Director of Cloud Services in Cloud Services, Indica Labs | |
12:10 – 12:50 | Lunch | ||
12:50 - 13:30 | Leveraging AI to Advance Discovery with HALO AI HALO AIによるAIを活用した発見の促進 This presentation will explore how HALO AI can be used for different research applications. In this session, learn how AI networks from Indica Labs are used throughout the HALO platform for common tasks like nuclear segmentation of hematoxylin-stained tissue to more specific tasks like segmentation of epithelial compartments based off of specific fluorescent dyes. We will cover: • What pretrained HALO AI networks are available for specific tasks • When and how to build and train a HALO AI network from scratch • How to use an AI network within HALO analysis modules • When AI Apps may be useful to speed the training process • Pathways to transition these HALO AI tools to clinical workflows HALO AIがどのようにさまざまな研究用途に活用できるかを探ります。Indica LabsのAIネットワークが、ヘマトキシリン染色組織の核セグメンテーションなどの一般的なタスクから、特定の蛍光染色に基づく上皮区分のセグメンテーションなどのより具体的なタスクまで、HALOプラットフォーム全体でどのように使用されているかについてお伝えします。取り上げる内容は以下の通りです: ・ 特定のタスクに使用できる事前学習済みのHALO AIネットワーク ・ HALO AIネットワークをゼロから構築および学習させるタイミングと方法 ・ HALO解析モジュール内でAIネットワークを使用する方法 ・ AIアプリを使って学習プロセスを高速化する場合 ・ これらのHALO AIツールを臨床ワークフローに移行するための道筋 | Anne Hellebust Director of Product, Life Sciences in Product Management, Indica Labs | |
13:30 - 16:30 | HALO AI hands-on seminar + Drinks Reception With Dr. Kitamura, CEO of N Lab, and Mr. Kalis, CEO of Callisto Inc. as advisors, and under the supervision of Professor Fukuoka (Nagasaki University), our staff will carefully guide you through the analysis methods that even AI beginners can immediately put into practice. You will learn how to use HALO AI step by step and how it can be used for analysis in the medical field. N Lab CEO 北村先生とカリスト株式会社 CEOカリス氏をアドバイザーに迎え、福岡教授(長崎大学)の監修のもと、AI初心者でもすぐに実践できる解析手法を弊社スタッフが丁寧に指導します。HALO AIの使用方法をステップごとに学び、医療現場での解析にどう活用できるかを習得していただけます。 | ||
16:30 | Closing Remarks | Hideya Makino Director of Japan, Indica Labs |